截止2019.7 共有4条线（第5条在建），分别是：荃湾线(红色)、港岛线(绿色)、港深西部快线(黄色)、屯马线(蓝色)。此外还有东涌线等两条支线。
具体线路如图所示，以下分别介绍4条主干线的特点：
一、荃湾线（红） 二号线 全程地下 全线通车
二、港岛线（绿） 三号线 地面及地下 全线通车
三、港深西部快线（黄） 接驳深圳地铁，与广深铁路互换乘 四号线 年末开通 先地下后高架
四、屯马线（蓝） 年中开通 先隧道后高架 港铁在港内采用“高度集约化”建设模式，即一条路线同时修建多个区间，中间不分开修筑，因此可以看到一些“一隧连两站”的情况。这种模式虽然节省了工期，但也使得地铁的换乘变得格外不方便，一个站点往往需要走很长的路。这也是很多乘客所诟病的地方。
值得一提的是这条线的车站设计颇具特色，大部分采用了透明玻璃幕墙+站内灯光设计，使整个站台显得通透明亮，而且能在远处就看到车来了，方便候车。
五、第五号路线（橙） 连接新界西部的北环线和东部的大屿山机场，是港铁有史以来投资最大的一条线。因为线路长度达到63公里，预计载客量达每趟1万名，是地铁路网中重要的一环。
轩辕凤兰优质答主香港岛线：设有15个车站，全线以金色作代表。金表示富贵吉祥，隐有香港岛是全香港主要经济中心及集中地。列车则采用黄、黑双色间隔设计。
观塘线：设有17个车站，全线以绿色作为代表色。绿表示香港为“亚洲绿色心脏”，亦表示观塘线连接香港岛和九龙的主要地区。列车则采用绿、黑双色间隔设计。
荃湾线：荃湾线共有16个车站。荃湾线分为两段，弥敦道以东的一段以深蓝色为标志色，标志物是海洋生物：鱼。以表示该段线路为海滨沿线。弥敦道以西一段以海蓝色为标志色，以螃蟹作为该段线路的标志物。后来因行车关系而将两段合并，并改以深蓝色为全线的代表色，但螃蟹、鱼图案的灯箱依然保留。列车则采用红、白两色间隔设计。
将军澳线：共有11个车站，全线以粉红色作代表色。粉红色富有现代化色彩。列车则采用红、粉红双色间隔设计。
东涌线：有5个车站，全线以亮蓝色代表色。蓝指港岛北部的维多利亚港。由于东涌线和机场快线的列车共用机场站，并且东涌线与机场快线的列车可以互驶各自线路，因此东涌线列车采用机场快线的红、黑双色间隔设计。
马鞍山线：共有10个车站，全线以茶色为标志色。茶色有质朴和庄重的意思，象征了该线经过新界远离市区的市镇。列车采用茶、白色双色间隔设计。
西铁线：西铁线由上水以西分为港岛线和柯士甸线两条各自独立营运的支线，两条支线各自使用独立的路轨。而港岛线与柯士甸线在上水汇合，使用共同路轨驶往红磡站，汇合段路线名为上水线。由于上水线段有港岛线和柯士甸线两条路线行走，因此上水线段采用海蓝色为主色，而港岛线和柯士甸线各自则用上蓝色及紫色为代表色。港岛线列车采用紫色和蓝色两色间隔设计，而柯士甸线列车则采用深蓝及灰色两色间隔设计。
东西铁线：东西铁线在九龙由西九龙站至弥敦道一段有东西走向的共用路段，称为九龙干线。九龙干线与红磡站以东的港岛线段合称港岛线，红磡站以东的柯士甸线段合称柯士甸线。九龙干线采用棕色为主色，与港岛线段和柯士甸线段各自合并成为两段路线，并分别采用港岛线和柯士甸线的色彩设计（见以上港岛线和柯士甸线的颜色设计）。
